基金项目: 国家自然科学基金项目(编号:81970163); 安徽医科大学校科研基金项目(编号:2022xkj074);
作者:周碧;汤晓冬;李迎;张永平;胡绍燕
关键词:急性髓系白血病;IRF2BP2;转录调控;细胞增殖;细胞周期;CUT&Tag;MYC;
DOI:专辑:医药卫生科技
〔摘 要〕 目的 探索干扰素调节因子2结合蛋白(IRF2BP2)对AML细胞增殖的影响及分子机制。方法 使用CRISPR-Cas9基因编辑技术在人AML细胞株Kasumi-1和U937中敲除IRF2BP2,Westernblot检测IRF2BP2蛋白的敲除效率。使用显微镜观察、CCK-8、集落形成实验和流式细胞仪检测细胞表型,RNA-Seq检测U937细胞株中IRF2BP2敲除组和对照组的差异基因,基因富集分析(GSEA)探讨其下游分子机制,Westernblot检测下游差异基因的表达。使用靶向切割标签技术(CUT&Tag)鉴定IRF2BP2蛋白的直接靶点,并用集成基因组学查看器(IGV)可视化分析相应的结合信号。结果 与对照组相比,敲除IRF2BP2后,CCK-8实验显示AML细胞增殖受抑(P<0.05);IRF2BP2敲除组细胞集落数减少(P<0.05)、G1期比例延长(P<0.05);在U937细胞株中敲除IRF2BP2,差异基因显著富集到与MYC相关的信号通路,通路分子MYC、CDK4和CDK2的蛋白表达水平随IRF2BP2的下调而降低;使用IRF2BP2抗体在U937细胞株中进行CUT&Tag实验,IGV可视化分析显示MYC启动子区域存在显著的信号峰升高。结论 IRF2BP2通过靶向调控MYC影响AML细胞周期和细胞增殖。